Ну блин, это не механика КПП точно, КПП либо воет, либо хрустит-выбивает, но никогда нет такого что дёрнет и потом спокойно едешь, потом опять дёрнет... Такие симптомы либо карбы дают (хотя даже более прогнозируемо, например на разгоне резком), либо, если совсем непредсказуемо - электрика, да. Как раз на 5 передаче вступает в игру отсечка (по спидометру), вот я бы туда смотрел, что искать не знаю, сейчас народ придёт и подскажет...
Либо попробовать включить 4 передачу и проехать на ней с такой же скоростью, как на 5 при появлении дёргания, если будет так же дёргаться - стопудово приборка, тем более раз её мудрили.
Дёргает вообще как, как будто полностью тяга пропадает? На сколько по времени?