У меня на XJR400 такое было, когда поставил бензофильтр. Теперь владею XJR1300, видел под баком штатный бензофильтр. Мне кажется дело в нем, или другом элементе, который на оборотах не дает бензу поступать в достаточном кол-ве.
На ходу карбы обсыхают, начинают троить, а когда бенз тю-тю, то мотик глохнет. После остановки, карбы потихоньку снова заполняются топливом и все прекрасно работает. Вот моя версия.
Повторюсь, на XJR400 прям было видно через корпус бензофильтра автомобиля ОКА, как при повышении оборотов он постепенно пустел.... Так что ,заменив его сетчатым фильтром, все заработало, как надо.